基因检测技术介绍

一、 背景介绍：
        SNP（single nucleotide polymorphism），即单核苷酸多态性，是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态。一般来说，一个SNP位点只有两种等位基因，因此又叫双等位基因。SNP在人类基因组中的发生频率比较高，大约平均每1000个碱基中就有一个多态位点。有些SNP位点还会影响基因的功能，导致生物性状改变甚至致病。单核苷酸多态性是研究人类家族和动植物品系遗传变异的重要依据，因此被广泛用于群体遗传学研究（如生物的起源、进化及迁移等方面）和疾病相关基因的研究，在药物基因组学、诊断学和生物医学研究中起重要作用。根据实验目的和通量的不同，阅微基因通过以下五种方式来提供SNP检测服务：

服务项目：
服务编号        服务项目        内容说明        价格        周期
SNP01        TaqMan探针法        荧光定量PCR仪        询价        2-4周
SNP02        SNaPshot法        ABI 测序仪        询价        1-4周
SNP03        HRM法        荧光定量PCR仪        询价        1-3周
SNP04        MassArray法        Sequenom质谱仪        询价        2-4周
SNP05        BeadXpress法        Illumina BeadXpress        询价        10-15周

● SNaPshot法
该技术由美国应用生物公司（ABI）开发，是基于荧光标记单碱基延伸原理的分型技术，也称小测序，主要针对中等通量的SNP分型项目。在一个含有测序酶、四种荧光标记ddNTP、紧临多态位点5’-端的不同长度延伸引物和PCR产物模板的反应体系中，引物延伸一个碱基即终止，经ABI测序仪检测后，根据峰的移动位置确定该延伸产物对应的SNP位点，根据峰的颜色可得知掺入的碱基种类，从而确定该样本的基因型。对于PCR产物模板可通过多重PCR反应体系来获得。通常用于10-30个SNP位点分析（见图5），最多可以一次分析50个点位。

图5 人线粒体22个SNP位点的SNaPshot实验结果

二、送样要求：
细胞（≥106）、组织（≥300mg）、血液（≥1ml）、基因组DNA（体积≥20μl，浓度≥50 ng/μl）。

几种常见的基因测序技术的优缺点及应用

　　随着人类基因组计划的完成，人类对自身遗传信息的了解和掌握有了前所未有的进步。与此同时，分子水平的基因检测技术平台不断发展和完善，使得基因检测技术得到了迅猛发展，基因检测效率不断提高。从最初第一代以 Sanger 测序为代表的直接检测技术和以连锁分析为代表的间接测序技术，到 2005 年，以 Illumina 公司的 Solexa技术和 ABI 公司的 SOLiD 技术为标志的新一代测 序 (next-generation sequencing，NGS) 的 相 继 出现，测序效率明显提升，时间明显缩短，费用明显降低，基因检测手段有了革命性的变化。其技术正向着大规模、工业化的方向发展，极大地提高了基因检测的检出率，并扩展了疾病在基因水平的研究范围。2009 年 3 月，约翰霍普金斯大学的研究人员在《Science》杂志上发表了通过 NGS外显子测序技术，发现了一个新的遗传性胰腺癌的致病基因 PALB2，标志着 NGS 测序技术成功应用于致病基因的鉴定研究。同年，《Nature》发表了采用 NGS 技术发现罕见弗里曼谢尔登综合征MYH3 致病基因突变和《Nat Genet》发表了遗传疾病米勒综合征致病基因。此后，通过 NGS 技术，与遗传相关的致病基因不断被发现，NGS 技术已成为里程碑式的进步。2010 年，《Science》杂志将这一技术评选为当年“十大科学进展”。
　　近两年，基因检测成为临床诊断和科学研究的热点，得到了突飞猛进和日新月异的发展，越来越多的临床和科研成果不断涌现出来。同时，基因检测已经从单一的遗传疾病专业范畴扩展到复杂疾病和个体化应用更加广阔的领域，其临床检测范围包括高危疾病的新生儿筛查、遗传疾病的诊断和基因携带的检测以及基因药物检测用于指导个体化用药剂量、选择和药物反应等诸多方面的研究。目前，基因检测在临床诊断和医学研究的应用正越来越受到医生的普遍重视和引起研究人员的极大的兴趣。
　　本文介绍了几种 DNA 水平基因检测常见的方法，比较其优缺点和在临床诊断和科学研究中的应用，对指导研究生和临床医生课外学习，推进临床科研工作和提升科研教学水平有着指导意义。
　　1、第一代测序
　　1.1 Sanger 测序　采用的是直接测序法。1977年，Frederick Sanger 等发明了双脱氧链末端终止法，这一技术随后成为最为常用的基因测序技术。2001 年，Allan Maxam 和 Walter Gibert 发 明了 Sanger 测序法，并在此后的 10 年里成为基因检测的金标准。其基本原理即双脱氧核苷三磷酸 (dideoxyribonucleoside triphosphate，ddNTP) 缺乏PCR 延伸所需的 3'-OH，因此每当 DNA 链加入分子 ddNTP，延伸便终止。每一次 DNA 测序是由 4个独立的反应组成，将模板、引物和 4 种含有不同的放射性同位素标记的核苷酸的 ddNTP 分别与DNA 聚合酶混合形成长短不一的片段，大量起始点相同、终止点不同的 DNA 片段存在于反应体系中，具有单个碱基差别的 DNA 序列可以被聚丙烯酰胺变性凝胶电泳分离出来，得到放射性同位素自显影条带。依据电泳条带读取 DNA 双链的碱基序列。
　　人类基因组的测序正是基于该技术完成的。Sanger 测序这种直接测序方法具有高度的准确性和简单、快捷等特点。目前，依然对于一些临床上小样本遗传疾病基因的鉴定具有很高的实用价值。例如，临床上采用 Sanger 直接测序 FGFR 2 基因证实单基因 Apert 综合征和直接测序 TCOF1 基因可以检出多达 90% 的与 Treacher Collins 综合征相关的突变。值得注意的是，Sanger 测序是针对已知致病基因的突变位点设计引物，进行 PCR 直接扩增测序。单个突变点的扩增包括该位点在内的外显子片段即可，不必将该点所在基因的全部外显子都扩增。
　　因此，应明确定位要扩增的位点所在的基因外显子和该点的具体位置，设计包括该点在内的上下游 150 ~ 200 bp 的外显子片段引物。此外，尽管有NGS 的出现，但 Sanger 测序对于有致病基因位点明确并且数量有限的单基因遗传疾病的致病基因的检测是非常经济和高效的。到目前为止，Sanger 测序仍然是作为基因检测的金标准，也是 NGS 基因检测后进行家系内和正常对照组验证的主要手段。
　　值得注意的是，Sanger 测序目的是寻找与疾病有关的特定的基因突变。对于没有明确候选基因或候选基因数量较多的大样本病例筛查是难以完成的，此类测序研究还要依靠具有高通量测序能力的 NGS。虽然 Sanger 测序具有高度的分析准确性，但其准确性还取决于测序仪器以及测序条件的设定。另外，Sanger 测序不能检测出大片段缺失或拷贝数变异等基因突变的类型，因此对于一些与此相关的遗传性疾病还不能做出基因学诊断。
　　1.2 连锁分析　采用的是间接测序法。在 NGS 出现之前，国际通用的疾病基因定位克隆策略是建立在大规模全基因扫描和连锁分析基础上的位置候选基因克隆。人类的染色体成对出现，一条来自父亲，一条来自母亲，每一对染色体在同样的位置上拥有相同的基因，但是其序列并不完全相同，被称为父系和母系等位基因。遗传标记是指在人群中表现出多态现象的 DNA 序列，可追踪染色体、染色体某一节段或某个基因座在家系中传递的任何一种遗传特性。它存在于每一个人，但大小和序列有差别，具有可遗传性和可识别性。目前采用第二代遗传标记，即重复序列多态性，特别是短串联重复序列，又称微卫星标记。连锁分析是以连锁这种遗传现象为基础，研究致病基因与遗传性标记之间关系的方法。如果控制某一表型性状的基因附近存在遗传标记，那么利用某个遗传标记与某个拟定位的基因之间是否存在连锁关系，以及连锁的紧密程度就能将该基因定位到染色体某一位置上。1986 年 Morton 等提出优势对数记分法 (log odds score method，LOD)，主要检测两基因以某一重组率连锁时的似然性。LOD 值为正，支持连锁 ;LOD 值为负，则否定连锁。通过计算家系中的微卫星标记与致病位点之间的 LOD 值，可以初步估算二者间的遗传距离及连锁程度，从而确定该基因在染色体上的粗略位置。然后利用该区域的染色体基因图谱，分析定位区域内所有基因的功能与表达，选择合适的候选基因进行突变检测，最终将致病基因定位或克隆。
　　然而，采用连锁分析进行基因检测存在很大的局限性。不但所需遗传样本量较大，一般要求提供三代及以上遗传家系患者血样，而且数据量大、处理复杂、产出速度较慢、定位不够精确 ( 一般只能定位在染色体某一区间 )，这就使得研究工作繁重和定位基因的时间周期特别长。目前，连锁分析采用的单核苷酸多肽性和短串联重复序列还在使用，但经典的间接测序方法，如单链构象多肽性、变性梯度凝胶电泳和异源双链分析在美国已被淘汰，而在发展中国家作为研究手段还在有限使用。
　　2、新一代测序 (NGS)
　　主 要 包 括 全 基 因 组 重 测 序 (whole-genomesequencing，WGS)、全外显子组测序 (whole-exomesequencing，WES) 和目标区域测序 (Targeted regionssequencing，TRS)，它们同属于新一代测序技术。总体而言，NGS 技术具有通量大、时间短、精确度高和信息量丰富等优点，使得遗传学者可以在短时间内对感兴趣的基因进行精确定位。但这些不同的测序技术在测序范围、数据分析量以及测序费用和时间等方面又有很大差别，如果选择适合的方法，对于临床诊断和科学研究将起到事半功倍的作用。
　　2.1 目标区域测序　目前常用的是基因芯片技术。其测序原理是基于 DNA 杂交原理，利用目标基因组区域定制的探针与基因组 DNA 进行芯片杂交或溶液杂交，将目标基因区域 DNA 富集，再通过NGS 技术进行测序。其测序过程是通过把数以万计的 cDNA 或寡聚核苷酸置于芯片上制成列阵，将芯片上固定好的已知序列的核苷酸探针与溶液中含有荧光标记的相应核酸序列进行互补配对，根据测序仪所显示强荧光的位置和强度，获取每组点阵列信息，再利用生物信息学算法确定目的靶核苷酸的序列组成。测序所选定的目标区域可以是连续的 DNA 序列，也可以是分布在同一个染色体不同区域或不同染色体上的片段。目标区域测序技术，对于以往通过连锁分析将基因突变锁定在染色体某一片段区域内，但无法找出突变是一个非常好的进一步检测手段。2010 年，Nicholas等使用基因分型芯片联合连锁分析技术，成功发现头小畸形的新基因 WDR62，文章发表在《NatGenet》杂志。类似的研究在家族性胰腺癌中确定 8 个候选变异位点和在家族性渗出性玻璃体视网膜病变发现易感基因 TSPAN12。
　　基因芯片测序技术可以将经过连锁分析锁定了目标范围或经过全基因组筛选的特定基因或区域进行更深一层的研究，是解决连锁分析无法发现致病基因的有效手段。基因芯片技术对于已知基因突变的筛查具有明显优势，可以快速、全面地检测出目标基因突变。同时，由于目标区域受到了限制，测序范围大幅度减少，测序时间和费用相应降低。但基因芯片检测所需要的 DNA 的量要大，由于已提取的 DNA 存在降解的风险，用于基因芯片研究的血标本最好是冰冻的全血，这样可以使用于检测 DNA 的量有充分保证。
　　2.2 全外显子组测序 (WES)　外显子组是单个个体的基因组 DNA 上所有蛋白质编码序列的总合。人类外显子组序列约占人类全部基因组序列的 1%，但大约包含 85% 的致病突变。WES 是利用序列捕获技术将全外显子区域 DNA 捕捉并富集后进行高通量测序的基因分析方法。采用的技术平台主要是罗氏公司的 SeqCap EZ 全外显子捕获系统，Illumina 公司的 Solexa 技术和 Agilent 公司的 SureSelect 外显子靶向序列富集系统。其捕获的目标区在 34 ~ 62 M 之间，不仅包括编码区同时也加入了部分非编码区。NGS 的测序过程主要包括DNA 测序文库的制备、锚定桥接、PCR 扩增、单碱基延伸测序和数据分析。研究者根据测序仪捕获到在测序过程中掺入有不同荧光标记碱基片段，经计算机将荧光信号转化成不同颜色的测序峰图和碱基序列。基因测序结果与NCBI的SNP数据库、千人基因组数据库等国际权威数据库比对，最终确定是否为突变基因。
　　自NGS 技术问世以来，利用 WES 在临床疾病致病基因的鉴定研究中取得前所未有的成果。这些成果不仅集中在单基因遗传疾病，还在多基因影响的复杂疾病中获得大量相关基因的发现。在单基因遗传性疾病中，如视网膜色素变性、终端骨发育不良等发现新基因或已知基因新突变。在一些罕见的疾病中，如 Kabuki 综合征、家族性混合型低脂血症和脊髓小脑共济失调症等疾病中发现新的致病基因。同时，在小细胞肺癌、慢性淋巴细胞性白血病等肿瘤研究和诸如肥胖症、脑皮质发育不良等复杂疾病的研究中也取得丰硕成果。

　　WES 技术在筛查范围和检出率等方面较其他测序技术具有明显的优势。例如，对于采用 Sanger测序和基因芯片测序不能筛查出基因的样本，可以采用 WES 来进一步基因筛查鉴定。应用 WES技术能够获得较传统 Sanger 等方法对编码区测序更深的覆盖度和更准确的数据。由于信息量的大幅度增加，WES 可以获得更多个体的编码区信息，因此成为检测致病基因和易感基因位点的有效手段。与连锁分析定位方法比较，WES 对家系的要求并不十分严格，在单基因遗传病同一家系中有 2 ~3 个患者和 1 个正常人即可进行致病基因的鉴定研究，而不需要连续三代的遗传家系。由于不需要严格的三代以上的遗传家系，WES 使以前不能进行研究的家系成为可能。不仅对于单基因遗传病是一个很好的研究手段，对于许多常见病，如肿瘤、糖尿病等疾病也可进行大规模比较研究。
　　2.3 全基因组重测序 (WGS)　WGS 是对已知基因组序列的物种进行不同个体的全基因组的测序，经过数据分析后对序列进行拼接、组装并获得基因组图谱，或是对不同组织进行测序并分析体细胞突变的一种研究方法。尽管 WES 可以快速全面地找出个体基因组上的所有突变，从而找到个体间的差异，但对于外显子以外的区域则不能有效地进行基因检测。对于此种情况，目前还要借助WGS 进行全基因组检测。但由于人类基因组过于庞大，一次单端全基因组测序很难达到所需要的测序深度。因此，需要重复测序或双端测序，由此带来测序成本的大幅度提高和由于不能达到足够的测序深度所导致的结果准确性的降低。而对于临床疾病诊断和普通科研工作，其高昂的检测费用也是难以承受的。尽管如此，对于部分临床研究和 WES 不能解决的科研课题还需要借助 WGS进行更加全面的基因检测。
　　3、展望
　　NGS 的出现为新兴的基因组技术增添了无限的活力和想象空间。特别是基因芯片的问世和已在临床上应用于大样本的疾病筛查和基因诊断中所展现出的活力，以及其商业化发展的模式都令人鼓舞。在眼科是单基因病最常见的学科，利用芯片技术进行 Laber 病的筛查已使很多病因不清楚的视神经萎缩得到明确诊断。而原发性开角型青光眼是眼科最具隐蔽性和危险性的致盲性眼病，其致病基因或突变的鉴定研究对疾病筛查将有着非常重要的临床价值和巨大的商业价值。在新生儿糖尿病的筛查中采用基因芯片技术可以更加快速、全面经济，避免第一代测序过于繁琐和漏检。
　　基因芯片技术在产前诊断中更加具有发展前景。只要对孕妇进行 DNA 血液检查即可进行遗传疾病的筛查，避免以往通过羊膜穿刺抽取羊水进行有创检查的局限性和危险性。目前，基因检测技术水平的提升和检测费用的不断降低，发展大规模个体化基因检测在不久的将来成为可能。同时，药物易感性基因和疾病发生的易感基因的检测的深入开展，个体化医疗将在基因检测的基础上得以实现。有理由相信，随着人们生活水平的不断提高和健康意识不断增强，基因检测在未来医学发展中应用前景将十分可观。

下一代测序：癌症个性化治疗的核心

导读       
在实现癌症个性化治疗的道路上，下一代测序（NGS）技术发挥着不可取代的作用。这几年，NGS技术变得更加精确，它通过广泛的基因筛查，预测癌症的发病风险，帮助医生确定癌症不同亚型的特异性疗法。本文详细阐述了NGS在癌症个性化治疗中的现状、局限性以及发展前景。


毫无疑问，未来的癌症治疗将会根据患者特异性的生物标志物变得越来越个性化。在实现癌症个性化治疗的道路上，下一代测序（NGS）技术发挥着不可取代的作用。在过去的几年里，NGS变得更加精确，它帮助研究人员和病理学家实现了从单基因检测到多基因检测的完美转换。

NGS通过广泛的基因筛查，预测癌症的发病风险，帮助医生确定癌症不同亚型的特异性疗法。从另一方面来说，NGS通过解码不同癌症的基因变异信息，为医生更好的理解癌症的发病机制提供了很大的帮助。在了解患者遗传学信息的基础上，他们可以从多种癌症疗法中选择对病人最佳的治疗方案。

德克萨斯大学MD安德森癌症中心分子诊断部门主任Rajyalakshmi Luthra博士说：“如今，大多数的分子诊断实验室都在通过测序技术寻找与各种疾病相关的基因或其它标志物。我们知道每个癌症类型都可能有多个分子标记，为了更好的进行靶向治疗，我们不得不寻找更多的靶标。”

NGS在癌症治疗中的现状

虽然NGS技术在近些年取得了巨大的进步，但是它依然是一个相对昂贵的技术。尽管目前测几百个基因的成本可能只相当于五年前测单个基因的成本，但是每次检测的平均成本依然在2500-5000美元之间。出于这样的原因，NGS的发展大部分依然局限在大型的学术医疗中心和诊断公司的实验室中。

临床诊断公司BioReference Laboratories的研发主任Robert Daber表示，NGS的应用仍处于初级阶段，要想在使NGS使用更加广泛，我们必须做到以下两点：第一，它需要覆盖更多与临床相关的可控突变；第二，它需要使成本更加“亲民”，且具有实际的检测效果。

Luthra博士说：“三年前MD安德森癌症中心开始使用NGS技术，我们的目标是从分子水平对肿瘤进行分析，为临床医生治疗病人提供特异性标志物。然而，我们得到的肿瘤样本的数量其实非常有限，因此，我们不能像以前做试验一样一次只检测一个标志物。”

“其实，除了与临床相关的标志物，那些目前被鉴定为与临床无关的突变也一样重要。”Daber博士说，“可能有些突变只在极少数肿瘤（1%或1.5%）中被发现，但问题是，这些独特的突变究竟会影响癌症的发展，还是与不含这种突变的患者相差无几。目前，我们也没有明确的答案。”



NGS的局限性

因为NGS仍是一个非常新鲜的技术，仪器公司一直在不断寻找改善NGS检测方法以及他们提供的数据和信息工具的途径。这也是很多机构不想在他们的实验室开展NGS的原因，不断更新的成本实在太大了。

Luthra博士说：“厂商总是在不断努力改善他们的硬件和软件，当然，这也是合情合理的。任何一个新的有前途的技术都需要不断的进步。然而，在临床实验室中，你不可能总是回头验证之前的结果是否正确。在一些小型或中等规模的实验室，他们也不可能收集到足够的样本来重复验证。”

另一个在未来需要解决的限制因素是，肿瘤学家的遗传学素养应该进一步提高。美国阿拉巴马大学基因组科学Heflin中心的主任Bruce Korf博士说：“在基因组时代到来之前，临床医生需要进行大量的遗传学信息的学习，只有真正了解了基因组在疾病发生中扮演的角色，才能在实践中利用好它们。”



NGS在癌症治疗中的展望

当然，依据NGS技术完成临床决策还为时尚早，但是学术医疗中心和诊断公司每天积累的数据是进一步解开疾病秘密的关键。Daber博士说：“NGS让我们了解了如此多的基因，接下来我们真正需要做的是整理这些重要标志物的信息（包括检测方法、致病机理等），IT技术也可以为我们所用。”

Luthra博士补充说：“随着越来越多的标志物被鉴定出来，医生可以判断是否需要对患者进行多基因检测。商家可以先提供具有针对性的检测服务供一些小型的医院选择。如果医院需要更多的病人基因组信息，他们再选择更全面的检测项目。这样一来，NGS技术会进入更多的医院。”

尽管实现这一愿望可能需要好多年，但是Luthra博士依然相信，随着大数据的发展和进步，NGS技术必将为癌症个性化治疗提供更多的遗传信息依据，也会成为医院疾病诊治的有效媒介。

肺癌诊断：NGS检测优劣并存 肺癌分子诊断2015年入美国医保

导读       
在美国，已有多个基因检测项目被纳入国家医保范围。第九届纽约肺癌研讨会上，斯隆-凯特林纪念癌症中心实验室主任Maria E. Arcila提出：“基于二代测序（NGS）基因诊断技术将改变肺癌传统的诊断治疗方式。”肺癌分子诊断将在2015年1月1日正式纳入医保范围。


近日，第九届纽约肺癌研讨会上，斯隆-凯特林纪念癌症中心实验室主任Maria E. Arcila提出：“基于二代测序（NGS）基因诊断技术将改变肺癌传统的诊断治疗方式。”目前，表皮生长因子受体（EGFR）突变和兼并性淋巴瘤激酶（ALK）重排的检测已被广泛应用到非小细胞肺癌的筛查中，而二代测序技术将会提供更多的癌症基因信息。

Arcila对NGS服务对肺癌检测诊断的优势进行了分析：

1、NGS在治疗方案上能找到疾病相关遗传变异位点。在其他检测方法都无法得知病人致病的原因的情况下，用NGS检测对异质性恶性肿瘤相关的突变位点进行筛查，或许能找到疾病相关遗传变异位点。美国食品药品管理局（FDA）已经批准认可了110个与癌症诊断和医疗相关的生物标记位点。医生可以直接根据这些突变位点制定医疗方法进行治疗。

2、NGS用测序多个位点代替单个位点检测，能更好的利用样品减少取样次数。对于肺癌检测而言，一个难点就是检测组织的获取。病人只需要将一点组织寄送到一个实验室即可，不需要进行手术切大量组织送到不同实验室。另外，基因检测跟传统单个位点检测花费是一样的。

当然，即便肺癌基因检测有诸多好处，基于NGS的基因检测技术要想成为临床工具，还需要做很多工作。NGS基因检测方法产生的数据量过大，而且通常2-4周可以获得检测结果。开发人员正在试图缩短检测耗用时间，但是对于那些期望获得更多遗传信息又不想等太久的医生来说，目前最佳策略就是同时进行传统检测以及NGS检测。

最后，Arcila表示：“目前生物标记的应用都比较简单，他们低估了癌症的高度复杂性。未来的癌症治疗将突破针对单个突变进行单一治疗的模式。”

还有一个好的消息需要分享，现在已有多个基因检测项目被纳入美国国家医保范围。而肺癌分子诊断也将纳入医保范围，该项医保政策将于15年1月1日生效。

学习。。。。谢谢楼主。

不入医保，麻烦啊

中国二代测序服务公司一览表


早在DNA双螺旋结构（Watson and Crick,1953）被发现后不久就有人报道过DNA测序技术，但是当时的操作流程复杂，没能形成规模。随后在1977年Sanger发明了具有里程碑意义的末端终止测序法，同年A.M.Maxam和W.Gilbert发明了化学降解法。Sanger法因为既简便又快速，并经过后续的不断改良，成为了迄今为止DNA测序的主流。
然而随着科学的发展，传统的Sanger测序已经不能完全满足研究的需要，对模式生物进行基因组重测序以及对一些非模式生物的基因组测序，都需要费用更低、通量更高、速度更快的测序技术，第二代测序技术（Next-generation sequencing）应运而生。
以下清单按拥有的二代测序仪的多少排名：
1. 华大，128台Hiseq 2000。优势：
A、 仪器最多
B、 做二代测序的员工最多
C、 产前诊断市场先行者
D、 资本：资本雄厚，得到14亿人民币的风险投资
联系方式：400-706-6615
2. 诺禾致源，5台Hiseq 2000，2台Miseq。优势：
A、 专业做植物测序及信息分析
B、 资本：资本雄厚，得到风险投资的1千万美元的投资
联系方式：010-82837801
3. 药明康德基因组中心，2台Hiseq 2000，2台Miseq，1台Ion Torrent PGM，1台GA，1台Affymetrie。优势：
A、 质量：CLIA标准实验室，给国际药厂做测序
B、 人才：Life公司前三代测序研发主管任中心执行官，Illumina前北亚区测序技术主管任测序主任
C、 价格：价格国内最低。RNA-seq含分析，4200元/样本；smRNA-seq含分析，4200元/样本；外显子测序，10600元/样本
D、 成本最低：公司位于保税区，一切成本免税。7000人的公司，所有行政成本被摊薄。国际药厂的大订单，摊薄机器运行成本，并压低试剂采购成本
E、 资本：资本雄厚，是美国纽约证交所的上市公司
联系方式：021-50461070
4. 北京理化中心，1台Hiseq
A、 国营机构
联系方式：010-58717615
5. 贝瑞和康，1台Hiseq
A、 Illumina官方代理
B、 产前诊断先行公司
联系方式：100-610-8005
6. 上海生物芯片公司，1台Hiseq，Affymetrix，Agilent芯片，Illumina芯片
A、 拥有做芯片积累的大量高通量基因分析的客户
联系方式：021-51320288
7. 上海晶能，1台Hiseq
A、 Illumina官方代理
联系方式：400-720-8232
8. 上海美吉，1台Hiseq，1台454
A、 拥有Sanger测序平台，通过Sanger测序积累的大量客户
联系方式：400-660-1216
9. 苏州众信，1台Hiseq
A、 拥有上海生物信息众信的平台
联系方式：0512-62825492
10. 北京毅新兴业，1台Hiseq
A、 拥有Sequenome质谱平台
联系方式：010-82608397
11. 上海佰真公司，1台Hiseq，1台Miseq，1台PGM，1台454，1台Affymetrix
A、 拥有上海交大Bio-X的基因分析业内基础
12. 上海南方基因中心，1台Hiseq，3台454
A、 南方基因中心的余威，做细菌微生物的De novo有名
13. 上海派森诺，1台Hiseq
A、与上海桑尼是同一个老板，桑尼做一代测序，有一代测序的客户群
14. 联合基因，1台Ion Torrent PGM
A、临床健康分析
15. 中科院上海分院，1台Hiseq
A、针对中科院内部客户进行服务
16. 北京迈基诺基因科技有限公司，0台Hiseq
A、有自产的外显子富集试剂盒，做外显子有优势
联系方式：010-56265283
17. 北京市计算中心，0台Hiseq
A、强大的计算能力，各种数据的分析能力
联系方式：010-59341768
18. 北京百迈客，0台Hiseq，2台GAIIx
A、生物信息分析能力
B、联系方式：400-600-3186
19. 武汉未来组，0台Hiseq
A、生物信息分析能力
联系方式：027-87778707
20. 上海天昊生物，0台Hiseq,1台GA，1台3730
A、拥有对中等通量的SNP位点的Sanger法验证的专利
B、做一代测序，积累大量一代测序的客户
联系方式：400-065-6886
21. 上海其明信息公司，0台Hiseq，5台Affymetrix
A、依靠做Affymetrix芯片服务，积累了大量的基因组学的客户
联系方式：400-604-0030
22. 上海康成，0台Hiseq，2台GA
A、依靠做Aglient的生物芯片，和用Exiqon的锁核苷酸（LAN）技术检测microRNA，积累了大量的基因组学的用户
23. 北京博奥（北京生物芯片公司），0台Hiseq，5台Affymetrix
A、通过做生物芯片，积累了大量的基因组学客户
24. 广州爱健，0台Hiseq，1台GA
A、做个人基因组测序分析
25. 上海敏芯公司，0台Hiseq，1台代谢组分析仪
A、曾经是二代测序的生物信息分析供应商，现在主要转到代谢组分析
26. 上海烈冰公司，0台Hiseq
A、主要从事二代测序的生物信息学分析
27. 瑞科基因，0台Hiseq
A、生物信息学分析
28. 凯基生物
A、二代测序分销业务
29. 上海阿趣生物
A、生物信息分析
30. 艾博斯
A、生物信息分析
31. 安诺优达
A、临床基因检测
32. 博仕生物医学中心
A、生物信息分析
33. 博苑生物
A、生物信息分析
34. 上海丰核信息
A、生物信息分析
35. 广州瑞科基因
A、生物信息分析
36. 广州基迪奥生物
A、生物信息分析
37. 上海朗通生物
A、生物信息分析
38. 上海欧孚
A、二代测序相关试剂供应商
B、二代测序分销商
39. 锐博生物
A、生物信息分析
40. 上海锐金生物医药科技有限公司
A、二代测序分销商
41. 赛业生物
A、Complete Genomics的代理商
联系方式：400-100-8884
42. 上海生咨
A、生物信息分析
43. 翼科
A、生物信息分析
44. 上海英拜生物
A、生物信息分析
45. 武汉生物之美，1台GA
A、生物信息分析
46. 中美泰和
A、生物信息分析
B、二代测序分销商
47. 安诺优达
A、生命健康测序服务
48. 生工生物
A、庞大完整的一代测序的销售网络
说明：
1. GA已经被Hiseq淘汰，运行成本、数据产量、数据质量、机器稳定性都不如Hiseq，所以所有的GA都没有被完全统计进来。
2. Solid因为其技术过时，也无人再用。所以没有统计。
3. Miseq，因为其数据产量很少，几乎没有服务公司用它作为主力，所以，没有特别统计。
4. 其它有Hiseq，但对外不提供专业服务的单位，如北京遗传所，基因组所，上海水稻中心，不是服务机构，也没有统计进来。
作者：陈巍，药明康德 基因组学中心销售主任。

2012年中国DNA测序行业主要企业
排名        企业名称
1        深圳华大基因科技有限公司
2        生工生物工程（上海）有限公司
3        上海美吉生物医药科技有限公司
4        上海敏芯信息科技有限公司
5        上海康成生物工程有限公司
6        北京贝瑞和康生物技术有限公司
7        北京博莱明创生物技术有限公司
8        北京华大中生科技发展有限公司
9        上海派森诺生物科技有限公司
10        北京怡美通德科技发展有限公司

基因测序行业如何赚钱？

2014年2月，食药总局和卫计委一纸通知叫停了临床基因测序，原因是相关产品和技术并没有通过审批。未经审批就做诊疗，算是非法行医，属于严重违法行为。

但仅仅过了4个月，去年6月30日，食药总局就批准了二代基因测序产品上市。其中，华大基因的两款二代基因测序仪和检测试剂盒通过审批。

2014年12月22日，卫计委又评估公布了第一批高通量测序技术临床应用试点单位，此前两家获得二代测序注册证的华大基因和达安基因再次入选，即将开展产前筛查与诊断专业试点。

在临床基因测序应用被叫停之前，我国无创产检主要集中于一线城市的三甲医院或高端民营医院。数据显示，近三年来我国共有20万孕妇接受产前基因检测，市场规模约为10亿元。业内人士预计，如果无创产检针对30岁以上孕妇实现100%渗透，将为该行业带来76亿元市场容量；若针对全部孕妇实现50%渗透率，那么将带来140亿元市场容量。